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星艦基因與清華合作, 中國首個人工智能深度挖掘基因數據庫研究

2016-07-29 來源:今日商訊www.prtoday.cn

近日,星艦基因與清華大學生物信息實驗室在北京達成戰略合作協議,雙方從生物醫學數據的云計算、基因數據庫開發、應用人工智能挖掘分析高通量數據,人才引進等多方面進行深入合作,共同促進生物信息技術在健康服務和精準醫療領域的應用和發展,最終把科研成果運用到人類疾病的研究和治療中。

“清華大學生物信息學實驗室是中國頂尖的生物信息學研究機構,擁有世界領先的技術和科研人才;星艦基因是中國首家集人工智能技術與創客精神于一體的互聯網基因檢測公司,此次雙方的合作將促成國內首個人工智能深度學習技術在基因組學領域的應用。”星艦基因 CEO 莊滿生如是說。

目前國內的基因檢測行業普遍開始引入基因大數據和精準醫療的概念,即通過收集到海量的DNA信息,經過歸納計算,就有可能總結出這些特征的發生規律,甚至總結出疾病發生規律。理論上看這對未來精準醫療的貢獻是巨大的。

可實際應用中卻存在一些問題:人類發展到今天,DNA突變總量數以億計,現有技術只對突變頻率大于1%的部分進行研究解析。這本身就需要巨大的患者樣本量才能統計出與正常人群體突變基因的差異。對于突變頻率小于1%的部分,群體數量仍然是龐大的,但由于沒有統計學意義,在現有疾病分析中就被自動屏蔽掉了。基因檢測如果缺少對這部分突變的深入分析,可以說精準醫療只能被限制在狹小的范圍之內。并且生命是多維度的、系統性的過程,除了在DNA基因組層面外,我們將應用大數據和人工智能的方法,以前所未有的“分辨率”來研究與人類健康相關的每一個細節。

星艦基因的思路就是引入人工智能的深度學習技術,通過整理海量DNA測序數據,通過機器模擬人腦對信息的學習和處理過程,充分挖掘出全部樣本的數據價值,從而實現真正意義上的個性化精準醫療。

來自清華大學生物信息學實驗室的研究員魯志博士稱,目前已于星艦基因共建研究團隊。該團隊的研究包括建立數學模型,然后輸入健康人的全基因組序列和RNA序列,對模型進行訓練,使模型學到健康人的RNA剪切模式;借著通過其他分子生物學方法對訓練后的模型進行確認和校正;最后使用幾個目前已知的病例數據,檢驗模型判斷的準確性。“如果模型的深度學習分析變得足夠精確,這項技術對于直接分析突變頻率低的變異與疾病的關系,和加速基因組學研究與藥物開發的貢獻將是巨大的。”魯志博士說。

目前該合作團隊的技術還只能分析基因突變頻率大于1%的部分,以及引起的RNA可變剪切與疾病的關系,對于其他原因導致的疾病還在研究中。但即便如此,人工智能在基因組學分析中的應用仍值得期待,也許它會成為解碼基因與疾病奧秘的一把金鑰匙。

(正文已結束)

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責任編輯:雪豹
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